Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm3550W4VSN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms