Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms