Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vamp5Q9Z2P8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms