Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd3Q9Z2D8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms