Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stxbp4Q9WV89 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms