Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabbr1Q9WV18 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms