Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms