Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a4Q9QZR9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a4Q9QZR9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms