Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ripk3Q9QZL0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ripk3Q9QZL0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ripk3Q9QZL0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ripk3Q9QZL0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms