Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rdh11Q9QYF1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms