Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms