Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apbb1Q9QXJ1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms