Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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