Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms