Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trappc2lQ9JME7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Trappc2lQ9JME7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc2lQ9JME7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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