Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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