Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col5a3Q9JLI2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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