Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hmgn5Q9JL35 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hmgn5Q9JL35 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms