Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms