Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trem1Q9JKE2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trem1Q9JKE2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms