Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfra4Q9JJT2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra4Q9JJT2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra4Q9JJT2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gfra4Q9JJT2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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