Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scube2Q9JJS0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scube2Q9JJS0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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