Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lmbr1Q9JIT0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms