Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmod3Q9JHJ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmod3Q9JHJ0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms