Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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