Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgshQ9EQ08 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms