Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufs3Q9DCT2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufs3Q9DCT2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufs3Q9DCT2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ndufs3Q9DCT2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ndufs3Q9DCT2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ndufs3Q9DCT2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms