Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smg9Q9DB90 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg9Q9DB90 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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