Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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