Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms