Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4bQ9D8B3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms