Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D7E4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms