Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn23Q9D7D7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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