Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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MsraQ9D6Y7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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MsraQ9D6Y7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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MsraQ9D6Y7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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MsraQ9D6Y7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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MsraQ9D6Y7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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MsraQ9D6Y7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsraQ9D6Y7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms