Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tube1Q9D6T1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms