Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm5Q9D6G9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms