Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc9bQ9D6E4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc9bQ9D6E4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms