Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rab11fip1Q9D620 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rab11fip1Q9D620 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rab11fip1Q9D620 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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