Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PrameQ9D4Z5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrameQ9D4Z5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms