Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Phf6Q9D4J7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Phf6Q9D4J7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms