Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhd1Q9D4J1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Efhd1Q9D4J1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhd1Q9D4J1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efhd1Q9D4J1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Efhd1Q9D4J1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efhd1Q9D4J1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Efhd1Q9D4J1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms