Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms