Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syce1Q9D495 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms