Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chordc1Q9D1P4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms