Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps28Q9D1C8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms