Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zbed3Q9D0L1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Zbed3Q9D0L1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Zbed3Q9D0L1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Zbed3Q9D0L1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Zbed3Q9D0L1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed3Q9D0L1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Zbed3Q9D0L1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Zbed3Q9D0L1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed3Q9D0L1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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