Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2e1Q9D0D5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms