Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ChtopQ9CY57 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms