Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mis12Q9CY25 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms