Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufs4Q9CXZ1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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